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首頁 專家論壇 標本專家[文獻快訊] 優化預分析方法改善非小細胞肺癌(NSCLC)患者循環腫瘤DNA(ctDNA)中的KRAS突變檢測
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[文獻快訊] 優化預分析方法改善非小細胞肺癌(NSCLC)患者循環腫瘤DNA(ctDNA)中的KRAS突變檢測

2017-12-18 00:00來源:原版作者:JL Sherwood.et al.

文章出處:《Plos One , 2016 , 11 (2) :e0150197

文章導讀:

介紹:使用循環腫瘤DNActDNA)的非侵入性突變檢測是有吸引力的前提。這可以使沒有腫瘤樣本的患者獲得更多的治療選擇。

材料和方法:從45NSCLC患者分析外周血和匹配的腫瘤。我們調查了預分析變量對DNA產量和/KRAS突變檢測的影響:樣品收集管類型,溫育時間,離心步驟,血漿輸入體積和DNA提取試劑盒。

結果:2小時的孵育時間和雙倍血漿離心(2000xg)降低總體DNA產量,導致污染的基因組DNAgDNA)水平降低。抽血后72小時,與EDTA管相比,使用無細胞DNA血液采集管(cfDNA BCT)觀察到減少的污染和增加的KRAS突變檢測。血漿輸入量和使用不同的DNA提取試劑盒影響DNA產量。

結論:這項研究表明,NSCLC突變檢測成功的ctDNA恢復取決于預分析步驟。建議開發從ctDNA樣本檢測KRAS突變的標準方法,以盡量減少預分析步驟對突變檢測率的影響。在不能快速進行樣品處理的地方,使用cfDNA BCT管將是有利的。

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