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首頁 專家論壇 標本專家[文獻快訊] 保存劑和溫度對循環腫瘤DNA分析的影響
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[文獻快訊] 保存劑和溫度對循環腫瘤DNA分析的影響

2017-12-18 00:00來源:原版作者:S Parpart-Li .et al.

文章出處:《Clinical Cancer Research An Official Journal of the American Association for Cancer Research, 2017 , 23 (10) :2471

文章導讀:

目的:游離DNA(cfDNA)基因組改變的分析正在發展,作為檢測,監測和基因型惡性腫瘤的一種方法。從循環腫瘤DNA(ctDNA)分析的全血細胞部分分離液體的方法已經在很大程度上未被研究,盡管這些可能是測定性能的關鍵考慮因素。

實驗設計:為了評估血液處理對cfDNA和ctDNA質量和產量的影響,我們比較血清中的cfDNA水平和血漿中的cfDNA水平??紤]到血清ctDNA分析的局限性,我們評估了兩種血漿處理方法K 2 EDTA和游離DNA BCT(BCT)試管對cfDNA和ctDNA回收的影響。在兩種管類型中收集來自9名患有癌癥的患者的45個樣品。一旦收集,立即將血液加工成血漿或保持在室溫下,并在1,3,5或7天時加工成血漿。

結果:早在收集后24小時,從收集在K 2 EDTA管中的血液中分離的血漿含有隨時間增加的cfDNA水平升高,與BCT管相比沒有觀察到cfDNA水平顯著增加。當另外6例癌癥患者以相同方式采集的樣本在3天的過程中在4℃儲存在K 2 EDTA管中時,在BCT管中收集的樣品的總cfDNA和ctDNA水平相當。在第3天,在兩個試管中ctDNA水平有降低的趨勢,當在K 2 EDTA管中在4℃下儲存的情況下測量突變等位基因級分時,其更顯著。

結論:總之,血液處理的方法對cfDNA和ctDNA水平有很大的影響,在評價外周循環中的ctDNA時應該考慮到這一點。

版權聲明:

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